分子生物学における技術として、次世代シーケンサー（NGS）とFISH（蛍光 in situ ハイブリダイゼーション）は、それぞれ異なる目的と方法で使用されています。今回の記事では、FISHが次世代シーケンサーに取って代わられたという記述の背景と、両者の違い、そしてその関係性について詳しく解説します。
次世代シーケンサー（NGS）とは？
次世代シーケンサー（NGS）は、DNAやRNAを高速でシーケンシング（塩基配列解析）する技術です。この技術は、従来のサンガー法と比べて格段に高速かつ低コストで、大量のデータを同時に解析できるため、ゲノム解析や遺伝子発現解析、メタゲノム解析など、さまざまな分野で広く利用されています。
NGSは、数百万～数十億の塩基配列を並行して読み取ることができるため、従来の技術では実現できなかった大規模なデータ解析を可能にします。これにより、個別の遺伝子の変異やゲノム全体の構造を一度に把握することができます。
FISH（蛍光 in situ ハイブリダイゼーション）とは？
FISHは、細胞や組織内で特定のDNAやRNA配列を可視化するための技術です。蛍光標識されたプローブを使って、目的の遺伝子や配列がどの位置に存在するかを調べることができます。この技術は、染色体上の遺伝子の位置を正確に特定するために使われ、染色体異常や遺伝的疾患の研究にも利用されています。
FISHは、遺伝子の局在情報を視覚的に示すため、遺伝子の機能や発現パターンの理解において非常に有用な技術ですが、ゲノム全体の解析には時間がかかることがあります。
NGSがFISHに取って代わった理由
分子生物学において、「FISHの役割は次世代シーケンサーに取って代わられた」という記載は、NGSの急速な進歩によるものです。NGSは、従来のFISHでは1つの遺伝子や領域にしか焦点を当てることができなかったのに対して、ゲノム全体を高速に解析することができるため、より広範な遺伝子の情報を同時に得ることができます。
また、NGSは、遺伝子の構造や変異、さらにはメチル化状態など、FISHでは把握しきれない情報も同時に提供するため、より詳細な解析が可能です。これにより、FISHが持っていた染色体上の位置関係の調査における役割が、NGSによってカバーされるようになりました。
NGSとFISHの使い分け
NGSとFISHは、目的に応じて使い分けが求められます。NGSは、全ゲノム解析や大量の遺伝子データの取得には非常に有効ですが、細胞や組織内で特定の遺伝子の位置を調べる場合には、FISHの方が有効です。
例えば、FISHは染色体異常を可視化する際に有効であり、NGSは複数の遺伝子の変異を同時に解析する際に強みを発揮します。これらの技術は補完的に使用されることが多いです。
まとめ
NGSとFISHは、いずれも遺伝子解析の強力なツールですが、それぞれの技術が得意とする分野において使い分けが必要です。FISHが次世代シーケンサーに取って代わられた理由は、NGSの速度と精度、そして大規模データの解析能力によるものです。今後も、両者は分子生物学において補完的に利用される技術となるでしょう。
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